ノコンギクとヨメナの花はどちらも淡紫色をしていて，よく似ています。
いがりまさし著『日本の野菊』（2007年）によると，淡紫色をした野菊には基本となるものが3種あり，それらの違いは次のようになります。
| ノコンギク | ヨメナ |
ヤマジノギク |
|
| 葉 | 卵形～長披針形。ざらつく | 卵形～長披針形。つるつるする | へら形～線形。ざらつく |
| 総苞片 | 卵形 | 卵形 | 線形 |
| 冠毛 | 長冠毛（筒状花，舌状花とも長い） | 短冠毛（筒状花，舌状花とも短い） | 異冠毛（筒状花のものは長く，舌状花では短い） |
| 生活型 | 多年草 | 多年草 | 基本的に2年草 |
| 分布 | 北海道～九州 | 本州，四国，九州 | 本州（静岡県以西），四国，九州 |
| 生育環境 | 耕地周辺から山地の林縁まで幅広い環境に生育する | 耕地周辺に多く，山地で見かけることはまずない。適湿な環境を好む |
山地の日当たりのよい草原や岩場。田んぼのあぜなどで見かけることはまずない。乾燥した環境を好む |
| 同定のポイント | この3種のなかで，もっとも広いエリアでふつうに見られる基本的な野菊。長冠毛であることを確かめればもっとも確実な同定法 | ノコンギクも同じような環境に生えていることが多く，遠目にはよく似ているが，葉を触って冠毛を確かめれば確実に同定できる | 線形の総苞片と異冠毛を確かめれば，ノコンギクやヨメナと間違えることはない。頭花はノコンギクやヨメナよりひとまわり大きい |
| 主な仲間 | シオン，シロヨメナ，センボンギク | オオユウガギク，コヨメナ，カントウヨメナ，ユウガギク | ハマベノギク，ヤナギノギク，ブゼンノギク |
ヤマジノギクはこの辺りでは見ないので，紛らわしいのはノコンギクとヨメナです。
それぞれ個体差が大きいので，色や形，大きさはあてになりません。
判別のポイントは，葉の手触りと，冠毛の長さにあるようです。
ノコンギクの葉はざらざらしているのに対し，ヨメナの葉はつるつるしています。
ヨメナは嫁菜とも書き，若葉を食用にするくらいなので，葉は優しい肌ざわりです。
冠毛の長さは，頭花をほぐして，ひとつひとつの花を見るとわかります。
ノコンギクは管状花，舌状花どちらにも，ふさふさの毛がついているのに対し，ヨメナには毛がありません。（正確には，ヨメナには冠毛がない訳ではなく，短いだけのようです）［写真6］［写真7］
これも「野」と「嫁」を対比させると，「嫁」は毛深くないということでしょうか。
- ［写真1］ノコンギク頭花
»»拡大 - ［写真2］ヨメナ頭花
»»拡大 - ［写真3］総苞片
左：ノコンギク 右：ヨメナ »»拡大 - ［写真4］葉
左：ノコンギク 右：ヨメナ »»拡大 - ［写真5］頭花断面
上：ノコンギク 下：ヨメナ »»拡大 - ［写真6］冠毛（左：筒状花，右：舌状花）
上：ノコンギク 下：ヨメナ »»拡大 - ［写真7］冠毛（左：舌状花，右：筒状花）
上：ノコンギク 下：ヨメナ »»拡大
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